火影忍者手游中的祈愿系统是玩家获取忍者碎片的核心机制，通过这一系统可以逐步收集拥有幻术技能的忍者。玩家需要达到25级并加入组织超过72小时才能参与祈愿，利用祈愿绘马许愿特定忍者碎片，组织内其他玩家可以将多余的碎片捐赠给许愿者，从而帮助解锁或升星忍者。
祈愿系统的碎片获取规则根据不同忍者等级有所区别，S级忍者要求碎片数量多于50个，A级和B级忍者需要多于20个，C级忍者则需多于5个。VIP等级越高，每次许愿可获得的碎片数量上限越多，同时每周捐赠次数也会增加，这直接影响收集幻术型忍者的效率。玩家应优先许愿那些以幻术见长的忍者，例如擅长干扰查克拉运行的写轮眼使用者，从而间接获取幻术技能。
幻术技能的获取与忍者类型紧密相关，幻术通过干扰查克拉运行来生效，部分忍者如人柱力或拥有尾兽的角色对幻术抗性较高，而高级幻术如月读需要更复杂的破解方式。在祈愿系统中，锁定这类忍者的碎片是获得幻术能力的基础，玩家需根据忍者技能描述判断其是否具备幻术特性。
提升祈愿效率的策略包括维持组织活跃度和合理分配资源，每周一晚上19点系统会补充祈愿绘马并重置捐赠次数，玩家应在此前后集中进行许愿和捐赠。通过积累忍者币或聚宝符参与祈愿夺宝，可以增加获得保底忍者的机会，进而提高解锁幻术技能忍者的概率，同时注意卡池轮换以调整许愿目标。
